Auf Linux ist nichts selbsterklärend. Deswegen würde ich hier fast schon empfehlen doch wieder auf Windows zurückzumigrieren wenn irgend möglich. Der Soonix ist nicht so der Informatikertyp dem ich das zutraue
Viele Linux Distros benutzen wie gesagt den ALT Key für systeminterne Sachen. Und da musst du dann eben in die Linux Einstellungen und das umstellen. Das kann man aber so pauschal auch nicht erklären weil es ja zig Desktoplösungen gibt, und die ticken alle ein wenig anders.
Hier hätte ich noch eine andere Möglichkeit ausgebuddelt. Das bedeutet aber auch Arbeit. Die Keymap exportieren, alle ALT Einträge durch oskey ersetzen, und dann wieder importieren
https://blender.stackexchange.com/questions/132722/change-modifier-key-from-alt-to-super-windows-key