Ich vermute mal:
Du hast bestimmt dein ganzes Rigg ausgewählt dann hast du auf Skeleton/Mirror Joints geklickt ?
Mirror Joint wird immer am 0 Punkt angewendet wenn du zb YZ im Mirror Tool ausgewählt hast dann wird dein Joint um die World Koordinate 0,0,0 gespiegelt.
Ich vermute mal dein Problem ist das dein Rigg nicht auf 0,0,0 ist sondern sich auf einer anderen Position befindet.
Falsch:
http://prntscr.com/cdfcm6Richtig:
http://prntscr.com/cdfcx2Zusatz:
Allgemein solltest du darauf achten das du jeden Joint über Modify/Freeze Transformation auf 0 setzt. Damit verhinderst du später das dein Rigg nicht richtig funktioniert.
1.Freeze Translate, Roate, Scale usw
2.Unbedingt die Pivots der Joints centern.
Ich hoffe das Problem ist klar